Após um ano e meio em Bruxelas a trabalhar na Comissão Europeia, como membro do gabinete do Comissário Carlos Moedas, no qual seguiu de perto sectores como a Bioeconomia, Agricultura, Pescas, Florestas, as chamadas Ciências Sociais e Humanidades, bem como as questões da Igualdade de Género na Ciência e Investigação e as relações com o Comité das Regiões, Mendes Bota acaba de assumir as funções de “High-Level Political and Parliamentary Adviser” na Delegação da União Europeia junto do Conselho da Europa em Estrasburgo, sendo o número dois desta representação diplomática.
O antigo deputado algarvio foi selecionado para esta missão, pelo prazo de quatro anos, na sequência de concurso aberto pelo European External Action Service. Para o êxito da candidatura contribuiu a sua longa experiência em instituições como o Parlamento Europeu, a Assembleia Parlamentar do Conselho da Europa e a Assembleia Interparlamentar Europeia de Segurança e Defesa, entre 1988 e 2014, a que se somou desde então o serviço até agora prestado na Comissão Europeia.
A União Europeia tem presentemente 139 delegações espalhadas pelo mundo, oito das quais junto de organizações internacionais, como é o caso, e que estão na dependência política da Alta Representante da União para as Relações Externas e Política de Segurança, Federica Mogherini, que exerce também as funções de Vice-Presidente da Comissão Europeia.
Entre outras atribuições, Mendes Bota focar-se-á na actividade da Assembleia Parlamentar do Conselho da Europa e do Congresso dos Poderes Locais e Regionais, nas relações entre o Parlamento Europeu e a APCE, bem como nos programas de cooperação entre a União Europeia e o Conselho da Europa para a defesa dos direitos humanos, o reforço das instituições democráticas e a promoção dos princípios do Estado de Direito.
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